El Comité Científico Externo fue propuesto y aprobado en el primer Consejo Rector del instituto, en julio 2012 y actualizado en diciembre de 2016. Ha mantenido acuerdos relacionados con la calidad científica del IBIMA. En la actualidad está compuesto por:
  • Carlos Diéguez González. Catedrático de Fisiología. Universidad de Santiago de Compostela. President
  • Armando Torres Ramírez. Director de la Unidad de Investigación del Hospital Universitario de Canarias (La Laguna, Tenerife). Jefe del Servicio de Nefrología del Hospital Universitario de Canarias (La Laguna, Tenerife). Catedrático de Medicina-Nefrología.
  • Magi Farré Albaladejo. Catedrático de Farmacología. Director de la Unidad de Ensayos Clínicos de Fase I, Institut Hospital del d'investigacions Mèdiques-IMIM, Barcelona.
  • Mariano Esteban Rodríguez. Departamento de Biología Molecular y Celular Centro Nacional de Biotecnología (CSIC).
  • José Carlos Florez. Profesor Titular Medicine Harvard Medical School. Center for Human Genetic Research. Diabetes Unit, Department of Medicine. Massachusetts General Hospital.
  • Rafael Bañares Cañizares. Jefe de Servicio de Medicina del Aparato Digestivo. Hospital General Universitario Gregorio Marañón. Madrid. Exdirector científico del IIS Gregorio Marañón (2011-2015)
  • Pablo Lapunzina Badía. Coordinador del Instituto de Genética Médica y Molecular (INGEMM) del Instituto de Investigación Hospital Universitario La Paz (IdiPaz) y Director Científico del CIBER-ER